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LncRNA測序

長鏈非編碼 RNALong non-coding RNA, LncRNA)是長度大于 200 個核苷酸的非編碼 RNA(不含 rRNA)。研究表明 , LncRNA 在劑量補償效應、表觀遺傳調控、細胞周期調控和細胞分化調控等眾多生命活動中發揮重要作用,成為遺傳學研究熱點。通過 LncRNA 測序,可以快速獲得與其生物學過程或者疾病相關的 LncRNA 表達變化,促進其深入研究。


LncRNA測序方案設計

LncRNA 實驗設計思路為差異比較,常見的類型為實驗組與對照組(case VS control),進行兩兩比較;若考慮時空因素,如按照不同生長發育階段或者疾病發生發展整個過程進行比較,即進行多重比較分析,然后對差異的LncRNA 進行靶基因預測和富集分析。一組樣品建議至少 6 個生物學重復。