利用全基因組重測序或簡化基因組測序(dd-RAD)技術獲得某物種自然群體各亞群的基因組信息,通過與參考基因組比對或聚類分析的方法得到大量變異信息,基于SNP信息討論群體的遺傳結構、基因交流情況、物種形成機制以及群體進化動態等生物學問題。
群體進化研究可以獲取物種的變異信息,從而獲得生物群體的遺傳特征。探究群體進化可以為動植物遺傳育種和瀕臨滅絕的動植物保護等提供理論依據,同時也可以為地球地質、生態、氣候、歷史人類活動變化的研究提供生物學佐證。
產品參數
基于重測序 | 基于簡化 | |
測序平臺及模式 | Illumina Novaseq, PE150 | |
測序深度 | >50x/個體 | 混合建庫;Tag數≥20萬,平均10x/Tag |
項目周期 | 標準分析40天 | 標準分析50天 |
樣本選擇 | 同一物種自然群體的不同亞種(或品系),每個亞群樣本數≥10; 群體數≥3;總體不少于30個樣本 | |
DNA樣本量 | 總量≥0.5 μg,濃度≥10 ng/μl (單個樣本) | 總量≥0.5 μg,濃度≥10 ng/μl (總樣本) |
參考基因組 | 必須有參 | 無參或參考基因組較大 |