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科研服務

動植物基因組全長測序

動植物基因組分析內容


序號

分析項目

1

下機數據統計

2

數據質控

3

數據獲取

4

Survey 分析

5

基因組拼裝

6

基因組拼裝效果評價

7

基因組拼裝完整性與連續性評估

8

重復序列分析

9

非編碼 RNA 預測

10

蛋白編碼基因預測

11

蛋白編碼基因的序列比對

12

蛋白編碼基因的 GO 注釋

13

蛋白編碼基因的 eggNOG 注釋

14

蛋白編碼基因的 KEGG 注釋

15

蛋白編碼基因的 Swiss-Prot 注釋

16

序列比對分析

17

SNP 分析

18

InDel 分析

19

種群統計學分析

20

基因家族分析

21

Venn 繪制

22

單拷貝基因的蛋白序列一致性分析

23

基因家族擴張和收縮分析

24

dNdS 分析

25

基于全基因組單拷貝基因的進化樹重構

26

分歧時間估算

27

基因組數據上傳