Illumina NovaSeq X Plus
Illumina NovaSeq 6000
NextSeq? 2000
PacBio revio
MGI DNBSEQ-T7
PromethION 24
Chromium controller
Chromium X
Visium CytAssist
Xenium
MobiNova?-100
CytOFLEX SRT 細胞分選儀
Orbitrap Astral
timsTOF Pro
Orbitrap Exploris? 120
Q Exactive HF-X
AB SCIEX QTRAP 6500+
LECO Pegasus HT TOFMS
1.ATAC-seq是否適合您?
ATAC能回答以下三個問題:
①找調控某一生物學過程的關鍵轉錄因子
②找哪個轉錄因子調控了我感興趣的基因
③找我感興趣的轉錄因子調控的靶基因
2.ATAC-seq與ChIP-seq異同點?
1.ATAC-Seq是在全基因組范圍內檢測染色質的開放區域,可以得到蛋白質的潛在結合位點,不依賴于抗體,一般用于不知道特定的轉錄因子。
2.ChIP-Seq是明確知道感興趣的轉錄因子是什么,利用特異性抗體富集蛋白質及其結合的DNA片段,從而驗證蛋白質與DNA的相互作用關系。