基因組框架圖和精細圖有什么不同？
框架圖能覆蓋基因組常染色體區域90%，覆蓋基因區域95%，Contig N5到5 kb，Scaffold N50達到20 kb，單堿基錯誤率在十萬分之一以下。精細圖能覆蓋基因組常染色體區域95%，覆蓋基因區域98%，Contig N5到20 kb，Scaffold N50達到300 kb，單堿基錯誤率在十萬分之一以下。
動植物基因組從頭測序時為什么需要構建不同類型的文庫？
因為動植物基因組大、復雜度高，且存在大量的重復區域，因此需要制備不同梯度的測序文庫，進行雙末端測序，使得在拼接中能夠跳過大范圍的重復區，從而避免了基因組中重復序列造成 的錯拼，提高了拼接的質量；同時結合BAC或Fosmid文庫以及多種測序平臺的綜合運用，保證了測序的準確性和基因組的完整性，從而完成高等動植物的基因組圖譜繪制。
在動植物基因組從頭測序中，不同測序平臺分別有什么優勢？
以Illumina 為代表的二代測序平臺，具有測序數據量大，成本低，可以為基因組測序提供高覆蓋率的數據的優勢。但是該平臺存在讀長短、具有 GC 偏好性等特點，難以跨過重復序列區域和高 GC 含量的區域。以PacBio 公司的RS II和Sequel 平臺為代表的三代測序平臺，具有讀長長（平均reads 長度 > 10 kb）、測序速度快（運行時間短，單個SMRT Cell的運行時間為2~6 hour）、通量高（平均每個 SMRT Cell 產生~8G有效數據）、無 GC 偏好性、能檢測堿基修飾信息（包括甲基化修飾）、無 PCR 偏向性（不需要經過 PCR 擴增，避免測序覆蓋的不均一性）等特點，尤其適合動植物基因組的從頭測序。根據物種基因組的特點及復雜程度，派森諾生物會科學地設計測序實驗方案，合理地將多個平臺搭配在一起使用，既能解決復雜基因組的測序難題，保證基因組測序的質量，同時也能兼顧實驗項目的經濟性。
