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轉錄組測序:解碼水果保鮮的“基因語言”

2025-05-11

水果從枝頭到餐桌,如何保持新鮮?采后儲藏是決定水果品質和經濟效益的關鍵環節。隨著科技發展,轉錄組測序技術正成為研究水果耐儲藏的“利器”,它能從基因層面揭示水果衰老、軟化和抗冷害的奧秘,為保鮮技術提供精準靶點!

河南科技學院園藝與園林學院發表2篇甜柿冷藏保鮮相關研究的文章,文中RNA-seq測序以及部分分析工作由上海派森諾生物科技股份有限公司完成

文章一

Glycine betaine treatment: Effects on alleviating chilling injury and related gene expression in ‘Youhou’ sweet persimmon during cold storage

雜志:Journal of Food Science

時間:2025-02-14

鏈接://doi.org/10.1111/1750-3841.70047

文章主題:甘氨酸甜菜堿處理甜柿可有效防止冷藏期間的冷害發生以延長儲存期。

組學技術:RNA-seq

文章要點:轉錄組測序分析表明甘氨酸甜菜堿處理顯著改變了甜柿的糖代謝、GSH代謝和苯丙烷類物質合成等相關基因的表達,為研究甜菜堿的冷藏保鮮作用機制提供了新思路。

技術路線

轉錄組結果展示

CK_vs_GB轉錄組分析

(a.樣本相關性;b.差異火山圖;c. DEG聚類熱圖;d.KEGG富集分析;e.差異轉錄組因子熱圖)

文章二

Treatment with 24-epibrassinolide protects ‘Youhou’ sweet persimmon fruit against chilling injury during cold storage

雜志:Scientia Horticulturae

時間:2025-03-19

鏈接://doi.org/10.1016/j.scienta.2025.114087

文章主題:24-表蕓苔素(EBR)內酯處理甜柿可提高抗氧化能力、防止冷害。

組學技術:RNA-seq

文章要點:EBR處理通過降低MDA含量和電解質相對滲漏率,降低ROS積累水平,提高AsA、GSH和花青素含量來緩解陽豐甜柿冷害。EBR處理同時還提高了PAL活性,降低了POD和PPO活性水平。此外,通過轉錄組測序結果顯示,EBR處理改變了與植物激素信號轉導、花色素苷生物合成、油菜素類固醇生物合成、糖代謝、苯丙素類生物合成、氧化應激和脂肪酸代謝等相關基因的表達水平

技術路線

轉錄組結果展示

CK_vs_EBR轉錄組結果

(A.樣本相關性;B.差異火山圖;C. DEG聚類熱圖;D.KEGG富集分析)

植物激素信號轉導和抗寒相關DEG

(A.通路熱圖;B.轉錄因子熱圖;C.抗寒基因熱圖)