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單細胞測序懸浮液制備專題-眼角膜組織

2023-08-03

前言

眼睛、一個美麗而神奇的器官。

人類眼睛內部的眼球近似球狀,由眼球壁和眼內容物構成。人的眼球壁由外至內依次為纖維膜、血管膜、視網膜。角膜作為眼球壁組成部分,是彎曲度大于眼球外壁其他部分的透明圓盤狀結構;正常人角膜中央薄(約0.5mm)周邊厚(約1.0mm);角膜由無血管的結締組織構成;含有豐富的神經末梢。


一、眼角膜結構簡介

人的角膜分為五層,由前向后依次為:角膜上皮(corneal epithelium)、前界層(anterior limiting lamina )、角膜基質(corneal stroma)、后界層( posterior limiting lamina )、角膜內皮(corneal endothelium)。

由于角膜的特殊構成,在解離過程中會出現細胞量較少且脆弱容易凋亡的情況。經過測試優化,小派提供一種高效、穩定的角膜組織解離方案,可獲得活性好、總量多、背景干凈的單細胞懸液。


二、解離方案

1、提前配制復合酶解離液(含木瓜蛋白酶、DNase Ⅰ等)及蛋白酶抑制劑。

2、從組織保存液中取出角膜組織樣本,放入預冷的 DPBS中清洗。

3、將清洗后的組織放到復合酶解離液中,用眼科剪將組織剪成碎片狀,轉移至含有剩余解離液的50ml離心管中,置于37℃水浴中震蕩消化 30-90 min,期間可使用巴氏吸管輕柔吹打組織,使其充分接觸解離液。

4、消化結束后,解離液通過 40um 細胞篩進行過濾,收集通過的細胞濾液至一新的無菌離心管中。

5、4℃,300 xg 離心 5 min,棄上清。向細胞沉淀中加入含蛋白酶抑制劑和DNaseⅠ的培養基重懸細胞,再通過低速離心,獲得背景干凈的細胞。

6、加入適量DPBS(含 2%FBS)重懸細胞,取20uL細胞懸液進行細胞計數和活力測定。(注:AOPI熒光計數、臺盼藍染色鏡檢)


三、結果展示

角膜組織

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(注:新鮮組織短時間內取出,盡快放入到組織保存液,送到實驗室)

鏡檢結果

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單細胞懸液背景干凈,細胞狀態好

活性、濃度檢測

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細胞活性95%,濃度655個/ul,總量在15W以上。

數據質控

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上圖是下機數據cellranger質控結果,細胞捕獲數及基因數都符合前期需求。