2019-07-08
Illumina 公司推出(chu)的NovaSeq 6000 SP芯片，其更(geng)高的測(ce)序(xu)通量及更(geng)短的測(ce)序(xu)周期都(dou)使得它能夠在(zai)眾(zhong)多測(ce)序(xu)平(ping)臺中脫(tuo)穎(ying)而出(chu)，尤(you)其是PE250測(ce)序(xu)策略的推(tui)出(chu)，讓我們在(zai)擴增子(zi)測(ce)序(xu)領域(yu)中看(kan)到(dao)了更(geng)廣闊的前景！
派(pai)森諾依(yi)靠(kao)強大的技術研發實力，和開拓(tuo)進(jin)取的精(jing)神，目(mu)前(qian)已經實現了菌群多(duo)樣(yang)性組成譜(pu)項目(mu)的NovaSeq SP芯片PE250測序！接下(xia)來(lai)小編按捺不住激動的心情(qing)，向(xiang)大家(jia)展(zhan)示派(pai)森諾NovaSeq SP芯片PE250實測數據及分析結果，讓我們一(yi)睹為快吧~
本次(ci)數據與MiSeq PE250數據進行(xing)對比，總結(jie)為以下幾點：
1
NovaSeq細菌16S rRNA基因(yin)堿基質量(liang)分布圖
NovaSeq真菌ITS1基因堿基質量分布圖
細菌16S rRNA基因與真菌ITS1基因NovaSeq測序質量表格
2
MiSeq與NovaSeq細菌16S rRNA基因門(men)和屬(shu)水(shui)平物種(zhong)相對豐度柱形(xing)圖
MiSeq與NovaSeq真菌ITS1基因門和屬水平物種相對豐度柱形圖
無論(lun)是細菌還是真(zhen)菌測序(xu)分(fen)析結果，都可以看出(chu)，兩種(zhong)測序(xu)平臺得到(dao)的物種(zhong)組成及豐度(du)分(fen)布保持高度(du)一(yi)致，優勢物種分布無(wu)差別；
MiSeq與NovaSeq稀(xi)有物種（<0.1%）數量對比
在隨機挑選的(de)(de)(de)8個樣品中，我們針對樣品中屬水平(ping)上的(de)(de)(de)稀有(you)物種（即相對豐(feng)度(du)低于0.1%）進行了數(shu)量統計，結(jie)果顯示，NovaSeq測序得(de)到(dao)的(de)(de)(de)結(jie)果能獲得(de)更(geng)多的(de)(de)(de)稀有物種，這對于我們研究關鍵物種意義重大，也展現了NovaSeq測序平臺更(geng)大數(shu)據(ju)規模測序的(de)優勢！
4
MiSeq與NovaSeq的Procrustes一致性(xing)比較分(fen)析
同時(shi)，Beta多(duo)樣性Procrustes一致性分(fen)析結果(guo)顯示，兩種測序平(ping)臺(tai)的同一樣品物種組成及(ji)豐度分(fen)布基(ji)本一致，且高度相關。
上述結(jie)果表明，作(zuo)為Illumina測(ce)(ce)序系統(tong)中的(de)“新貴”，NovaSeq平臺不僅能獲得和MiSeq平臺高(gao)度一致的(de)菌群組成結(jie)構，而且在測(ce)(ce)序質量上，也相比Q30>75%的(de)MiSeq、NovaSeq PE250模式官方質控標準，有大幅(fu)提(ti)升！更(geng)重要的是，在NovaSeq平(ping)臺上，能輕(qing)而易舉的實現大樣(yang)品量、高(gao)測序量的菌群(qun)(qun)多(duo)樣(yang)性組成譜解析，對于低豐度(du)物種的探測、以及菌群(qun)(qun)整體(ti)組成的分辨(bian)率也將(jiang)更(geng)精細！
派森諾也將一如既往(wang)地秉(bing)承“解析基(ji)因序列，詮釋生命(ming)密碼(ma)，改善人類生活(huo)”的(de)使命(ming)，始終貫(guan)徹“枝源派本，一諾千(qian)金”的(de)服務宗旨，繼續為大家帶來科研技術服務！
