2019-06-25
文案 | 轉(zhuan)錄(lu)調(diao)控(kong)事(shi)業部
轉錄組(zu)測(ce)序(xu)作為研(yan)究(jiu)基(ji)因(yin)(yin)表(biao)達(da)的利器，已成為分子生物學研(yan)究(jiu)領(ling)域常用(yong)的重要(yao)(yao)技術，轉錄組(zu)測(ce)序(xu)通過(guo)(guo)對mRNA反轉錄形(xing)成的cDNA進行測(ce)序(xu)從而分析(xi)基(ji)因(yin)(yin)表(biao)達(da)量，為了使(shi)cDNA濃(nong)度達(da)到上機測(ce)序(xu)要(yao)(yao)求，我們需要(yao)(yao)對cDNA片(pian)(pian)段進行擴(kuo)增(zeng)(zeng)。由于PCR擴(kuo)增(zeng)(zeng)具有偏好(hao)性(xing)，不同的cDNA片(pian)(pian)段被放大的倍數不均(jun)一，再加上測(ce)序(xu)過(guo)(guo)程中有些片(pian)(pian)段會被過(guo)(guo)度擴(kuo)增(zeng)(zeng)，這(zhe)能夠使(shi)我們了解基(ji)因(yin)(yin)表(biao)達(da)大體(ti)趨勢，但(dan)是(shi)無法滿足對基(ji)因(yin)(yin)原(yuan)始表(biao)達(da)量的絕對定量。
派森諾生物推出超(chao)低(di)RNA起始量(liang)的(de)(de)絕對定(ding)量(liang)轉錄組測序，將在cDNA擴增前，為(wei)所有cDNA片段添(tian)加上(shang)特異標簽-UMI（Unique Molecular Identifiers），通過計算與cDNA相連的(de)(de)UMI個數，就能準(zhun)確(que)獲得原始的(de)(de)cDNA數量(liang)，實現(xian)基(ji)因表(biao)達(da)的(de)(de)準(zhun)確(que)定(ding)量(liang)。
UMI絕(jue)對(dui)定量實(shi)驗原理
絕(jue)對定量轉錄組(zu)優(you)勢(shi)
? RNA起始量低(di)，更(geng)適(shi)合量少與珍貴樣品
? 基因(yin)表達(da)水(shui)平的準確定(ding)量(liang)，避免(mian)低(di)豐(feng)度基因(yin)丟(diu)失
? 準(zhun)確定(ding)量動植物中寄(ji)生(sheng)菌(jun)的轉錄本
? 可(ke)(ke)區分天然重復(fu)(fu)與(yu)擴(kuo)增重復(fu)(fu)，準確識別(bie)可(ke)(ke)變(bian)剪切事件
? 校(xiao)正擴增過程中出現(xian)的(de)堿(jian)基錯(cuo)誤，使(shi)RNA編輯分析更(geng)為準確(que)
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參考文獻(xian)
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