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單細胞測序項目經驗合集-植物樣本抽核

2025-09-12

在植物單細胞測序研究中,獲取高質量的細胞核是后續實驗成功的關鍵前提。相較于原生質體分離,植物樣本抽核技術能突破細胞壁堅韌、組織纖維化等限制,適用于更多難解離的植物組織(如木質化莖稈、成熟種子),且能有效保留細胞異質性。今天,我們就從抽核方法,常見問題與解決方案,全方位分享植物樣本抽核的實戰經驗,幫你避開科研 “坑點”。

派森諾單細胞平臺已成功完成5000+單細胞樣本測序,有著豐富的項目經驗,以下是部分派森諾曾做過的植物組織抽核樣本類型:

一、抽核方案

1. 樣本處理

凍存的植物組織在液氮中研磨成粉末狀,轉移至5ml管中備用。

2. 細胞核釋放

加入3ml NIB裂解液,使用組織研磨儀磨碎組織,使細胞核釋放,DAPI觀察細胞核釋放情況。

3. 清洗

使用NB溶液終止細胞核裂解,離心(根據不同組織類型調整離心力,范圍在500-1000g),5min。

4. 去雜質

通過流式分選DAPI陽性的細胞核,進行去雜質處理

5. 質檢

流式分選后的細胞核離心,合適體積重懸后使用AOPI染料計數,熒光顯微鏡觀察細胞核完整度。

二、常見問題與解決方案

1. 細胞核破裂率超過 20%怎么辦?

  • 研磨時減少時間(如從 5min 縮短至 3min),或更換為玻璃勻漿器(力度更溫和);

  • 降低離心轉速(如從 1000×g 降至 800×g),延長離心時間(從 10min 增至 15min)。

2. 細胞質 / 雜質污染嚴重怎么辦?

  • 增加過濾次數(如先用 70μm 篩網初濾,再用 40μm 篩網精濾),并確保每次過濾后用 NB 沖洗篩網;

  • 在 NIB 中加入 2% PVP(去除酚類雜質)

三、部分結果展示

楊樹根尖

楊樹葉片

楊樹莖

棉花根

柳樹葉片