2025-09-02
細胞集的創建是單細胞數據分析中的核心環節，細胞集創建分為兩大模塊，包含6種創建細胞集的方式，分別是基于細胞質控結果創建、單個細胞交互式框選創建、多個細胞集合并創建、細胞注釋標簽修改、細胞重命名、細胞亞群與母群之間的映射。通過以上方式，我們可以靈活創建細胞數據集。文章還將詳細說明功能頁面中的各項參數，以幫助科研人員更好地理解與使用本平臺。
一、細胞集創建
1.基于細胞質控結果創建
簡介：基于細胞質控的結果，可一鍵創建細胞集，對質控得到的高質量細胞群進行聚類分群以及使用cellID軟件參考派森諾自助研發的注釋marker基因數據庫（PSN_Marker_V1）進行自動注釋。
2. 單個細胞交互式框選創建
創建方式：單個細胞集除了通過類群名來選擇要分析的亞群細分的細胞類型，還可以繼續在降維圖（如Umap/Tsne）上框選細胞去分析。
3.多個細胞集合并創建
創建方式：可以下拉選擇多個細胞集進行合并分析。
4.細胞注釋標簽修改
功能：單細胞聚類分析生成的細胞亞群添加生物學標簽。可根據標記基因或已知特征，手動或自動為每個Cluster賦予具體名稱。
5.細胞重命名
功能：支持對現有細胞類型命名支持直觀快捷修改。
6.細胞亞群與母群之間的映射
功能：通過構建細胞亞群與母群之間的層次關聯，實現細胞亞群標簽向母群的精準映射。
二
細胞集可視化
根據創建成功的細胞集名稱，通過下拉選擇可快速調取對應結果。從聚類分群圖譜（Umap/Tsne）、亞群注釋細胞注釋barplot圖，來展示細胞集結果分析可視化。
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