2025-08-28
本文介紹六款分屬不同領域的分析圖表:
差異箱線圖用于統計比較;交互熱圖解析相關性;韋恩圖展示集合關系;網絡熱圖展示組學內及組學間的關聯關系;KEGG分析揭示功能富集;交互PCA圖實現數據降維。它們為您提供從基礎統計到生物信息學的多種分析場景。
一、差異檢驗箱線圖
用于比較兩組或多組數據的分布差異,并標注統計顯著性(如P值)。
圖表顏色
可切換不同的色卡,運用在圖表上
面板設置
設置每個分組的面板的寬度
二、交互熱圖
展示多個樣品之間的關系或相關性。顏色(紅色表示正值 / 藍色表示負值)越紅表示正相關越強,越藍表示負相關越強,可快速識別樣品間的相似性與差異性。
單元格樣式
支持正方形、顏色、橢圓、數字
聚類顯示
支持對行和列、僅行、僅列進行聚類,也可選擇不聚類。
名稱顯示
靈活控制行、列標簽的顯示方式
單元格寬高設置
根據需要調整單元格的寬高
衍生圖表類型:
交互環形熱圖:節省空間,適合展示多層級數據(如基因組環狀結構)。
交互熱圖柱狀圖:整合熱圖與柱狀圖,同時展示矩陣分布和統計信息。
三、韋恩圖
通過圓形的重疊關系展示有限集合(通常為2–5個)之間的邏輯關系及共同元素數量。
圖表類型
經典韋恩圖、齒輪韋恩圖
圖表顏色
支持按分組自定義配色
衍生圖表類型:
花瓣圖:適用于5個以上數據集的交集關系,中心區域顯示所有集合共有的元素數量,外圍花瓣代表各樣本獨有的元素數量。
Upset圖:支持7組以上數據,通過矩陣點圖與柱狀圖的組合,量化展示多組數據的交集關系。
四、網絡熱圖
由熱圖和網絡圖組成,其中熱圖可展示組學內的相關性,而網絡圖可展示組學間的關聯性
豐度數據
1.按照需求添加Node節點
2.提供距離算法:bray、manhattan、euclidean、canberra、bray等10種方法
3.檢驗方法:mantel、mantel.randtest、mantel.rtest、mantel.partial
因子數據
1.標準化:是否標準化
2.提供距離算法和相關性算法
熱圖圖表
可設置熱圖位置(右上角或是左下角),通過格子大小、顏色等方式表示相關性
顯著性標簽設置
標簽類型:支持星號+r值、星號、無;可調整標簽大小和顏色
五、KEGG富集分析
富集分析是生物信息學中用于解析基因功能、揭示生物學過程和通路的重要方法。
柱狀圖:縱坐標為GO Term,橫坐標默認為GO Term富集的-log10(p-value),可選擇p-adjust或差異基因(DEG)數目進行展示。
圖表顏色
下拉切換不同色卡運用圖表,還可編輯色卡顏色
圖表類型
垂直/水平柱狀圖
圖表寬高
可靈活調整寬高,用來滿足繪圖需求
因子圖:橫坐標為富集因子(rich factor),縱坐標為GO Term,圖中點的大小表示相應Term中富集到的差異基因數目,顏色的深淺表示顯著性水平高低。
圖表顏色
可切換不同的色卡,運用在圖表上
寬高系數
對于有標簽遮擋的地方,可調整圖表的寬高進行合理展示
檢驗方法
BH、Bonferroni、Holm
通路數目
根據提供的參考范圍,合理的輸入數值
六、交互PCA圖
對多個變量進行降維后提取幾個特征變量。
圖表顏色
可切換不同的色卡,運用在圖表上
圖表樣式
添加網格線、原點輔助線、添加中心點連線、添加邊框
圖表類型
散點圖、按組連線、置信橢圓
點的樣式
點的形狀與大小
衍生圖表類型:
3D主成分圖:展示前三個主成分,信息更豐富。
主成分圖:對多個變量進行降維后提取幾個特征變量。
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