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蛋白定量系統3大核心功能全拆解,附實操指南

2025-08-06

為滿足科研中對蛋白定量分析日益增長的需求,我們的蛋白定量云分析系統新增諸多實用功能與內容。為了幫助您快速上手新產品,下面將圍繞蛋白集的創建方式、比較組方案的新建以及差異蛋白篩選這三項關鍵內容,為您詳細介紹具體用法,讓您能迅速掌握系統操作,快速完成分析任務。

一、蛋白集的創建和運用

1. 蛋白集的創建方式

a.自定義上傳蛋白集文件:可自行上傳蛋白集文件,上傳成功后,能將所有的蛋白集文件進行任意合并,從而創建新的蛋白集。

b. 通過蛋白表創建

  • 差異蛋白表:用差異蛋白表創建蛋白集,創建成功后,可通過切換蛋白表來查看該蛋白集。

  • 功能富集創建的蛋白表:在分析設置的蛋白集下拉選項中,可切換基于此方式創建的蛋白集數據。

  • 富集表:通過富集表創建蛋白集時,無需在頁面進行額外操作。

c.通過維恩圖創建:點擊維恩圖圖上顯示的數據,來創建蛋白集,創建成功之后在分析設置模塊,可以找到新建的蛋白集。如果想要對新創建的蛋白進行分析,請至少選擇兩組蛋白數據進行分析。

2. 蛋白集查看管理:對于已經創建成功的蛋白集,我們可以在蛋白集管理頁面進行統一查看。

二、比較組方案的創建和運用

1. 兩兩比較方式

  • 非配對樣品比較:此方式無需對樣品進行配對,直接將兩兩分組進行比較。

  • 配對樣品比較:針對兩兩分組中的樣品開展一對一比較。同時,對于處理組的分組中的樣品,系統提供下拉切換功能,方便我們選擇不同樣品,讓樣品調整更加靈活。

  • 單樣品比較:要求分組方案對應的樣品必須是單樣品,若存在多個樣品,需要修改對應的分組的數量,上傳分組方案后,再去新建比較方案。

2. 多組比較方式: 分組大于等于三組,才能進行比較分析。

三、差異蛋白篩選方式新升級

1. 篩選流程優化:增加先對篩選結果進行過濾的步驟,查看結果滿意之后再進行提交,以此提高分析效率。

2. 篩選方式

  • 分區篩選:分別對UP和DOWN蛋白進行篩選,有助于精準定位關鍵差異蛋白。

  • 總體篩選:通過取TOP值的方式進行篩選,能夠快速獲取最具顯著性的差異蛋白。

  • 自定義篩選:可復制Protein_ID進行篩選,滿足特定的篩選需求。

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