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掌握5款熱圖工具:零代碼實現SCI級數據可視化

2025-05-02

熱圖圖表依據分析深度和復雜度,可劃分為不同層級,從基礎相關性分析,逐步深入到多維數據整合,最終實現復雜網絡分析。

基礎相關性分析:交互熱圖和交互環形熱圖;

多維數據整合:交互熱圖柱狀圖和交互關聯熱圖;

復雜網絡分析:網絡熱圖。

1.交互熱圖

展示多個樣品之間的關系或相關性。顏色(紅正 / 藍負)越紅表示正相關越強,越藍表示負相關越強,可快速識別樣品間的相似性與差異性。

2.交互環形熱圖

環形展示多個樣品之間的關系或相關性。顏色(例如紅正/藍負)仍代表相關性強度,適合探索具有環狀結構的數據關系。

3.交互熱圖柱狀圖

通過熱圖加柱狀圖形式從兩個維度展示數據特征并反映樣本 / 組內或組間的差異。

4.交互關聯熱圖

通過交互熱圖的形式展示物種豐度和生化指標或影響因子之間的相關性。

當繪圖出現圖下圖所示的情況,首先可以更換相關性算法、相關性系數p值篩選選大一點的數值,R值調整小一些,放寬條件后如果還是不行,那就說明數據本身在設定參數條件下,沒有顯著關聯的數據記錄。

5.網絡熱圖

圖形由熱圖和網絡圖組成,熱圖展示組學內的相關性,網絡圖展示組學間的關聯性。以微生物矩陣與環境因子矩陣關聯關系為例

熱圖:展示各環境因子之間的相關性。

1. 相關性大小:以顏色梯度(紅正 / 藍負)與格子大小雙重映射相關性值,顏色為紅色且格子大,表明相關性絕對值大;反之則小。顏色趨近紅色正相關強,趨近藍色負相關強。

2. 相關性標注:熱圖格子內數值為環境因子相關性值,星號表示顯著性大小。

網絡圖:展示微生物矩陣與環境因子矩陣之間的關聯關系。

1. 節點構成:微生物矩陣包含node、node1、node2三類節點。

2. 關聯呈現:

a.粗細:節點與環境因子連線粗細反映相關性,越粗相關性越強。

b.顏色:連線顏色體現顯著性,紅色代表P值<0.01,即節點與環境因子相關性統計顯著。

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