2025-01-21
好消息！
PacBio旗艦單分子測序平臺Revio迎來重大升級！
北京時間2024年10月30日凌晨，PacBio推出了SPRQ化學技術，這是HiFi測序自2019年發布以來的最重大更新。派森諾生物秉持緊跟科學發展前沿的原則，并在近期完成了第一批數據測試，接下來讓我們一起來看一下SPRQ聚合酶的亮眼表現吧！
亮點1：數據量產出高且穩定
圖 SPRQ升級前（左）后（右）單cell數據量產出
據統計，升級前PacBio Revio平臺單cell平均產出90.69G數據，使用SPRQ試劑后單cell產出數據達到了驚人的135.49G，增長49.4%！
亮點2：數據準確性高
圖 SPRQ升級前（左）后（右）Q值統計
升級前，大多數reads平均質量值(Q值)集中在30左右，使用SPRQ試劑后reads平均質量值集中在35-40，高質量reads占比明顯增多，Q值達到38.56。
亮點3：長讀長特點突出
圖 升級后HiFi Reads長度分布部分統計結果
使用SPRQ試劑之后，PB長讀長的特點依然比較突出，平均讀長為17893bp。
亮點4：甲基化檢測效果提升
圖 SPRQ升級前（左）后（右）5mC檢測的準確率統計
通過機載分析流程的算法升級，提升了5mC檢測的準確率并新增了6mA檢測。
亮點5：起始量低
據PacBio官方消息，SPRQ技術對樣本的需求量不高，我們后續也將大幅下調HiFi測序的樣本起始量，大家可以狠狠期待一波。
總結
實測數據表明，新試劑在保證了PacBio HiFi測序高精度和長讀長特點的基礎上，大幅度提高了通量，且同步提高了甲基化檢測的準確率。
注：針對哺乳動物和常規作物等樣本類型，派森諾承諾三代HiFi數據產出達110G以上。
派森諾三代全長適用產品：
基因組de novo ：針對基因組序列未知或參考基因組組裝不理想的物種，構建不同類型的基因組DNA文庫，并進行序列測定。然后使用生物信息學方法對序列進行拼接、組裝和注釋，從而繪制該物種完整的基因組序列信息。
全長轉錄組：基于PacBio三代測序平臺的全長轉錄組測序，可直接獲得mRNA的全長序列，更為準確地解讀mRNA的結構信息。通過全長轉錄組測序，可克服無參考基因組物種轉錄本拼接短、信息不完整的難題，獲取全長mRNA序列，實現同源異構體分析，單堿基變異檢測， 可變剪接分析，同源基因識別及等位基因識別。
菌群多樣性組成譜全長測序：基于PacBio三代測序平臺，能夠讀取群落微生態系統中微生物的rRNA基因/ITS全長序列，不受制于短序列的局限性，并確保全長序列的測序，從而在種甚至菌株等精細水平，解析菌群多樣性和組成譜。
三代宏基因組測序：三代宏基因組測序技術以其長讀長、高準確性、低豐度微生物檢測能力和高物種鑒定分辨率等特點，在多個領域展現出廣泛的應用前景和重要的研究價值。基于PacBio HiFi測序技術的宏基因組測序，憑借長讀長及Q30+的高測序準確度，可以輕松覆蓋基因區間或基因特異性區域，大大降低了拼接錯誤，能快速精準的獲得微生物信息，提高組裝的完整度和注釋的精確度。
